{:en}Tuberculosis (TBC) is still a serious global health problem. It is estimated that 10 million people are infected with TB every year worldwide. More than 95% of deaths from tuberculosis occur in developing countries. Indonesia is one of the countries with the most TB problems (high burden country)) and was ranked third after India and China. It is estimated that there were 845,000 TB cases in Indonesia in 2018 and 24,000 of them were drug resistant TB cases. The main causes of the high TB cases are poverty, less optimal TB treatment programs and demographic changes due to an increasing population. Besides its treatment, diagnosis of TB has an important role in overcoming this problem. In a simple method, the diagnosis of TB can be done by looking at the sputum smear using a microscope. However, this method has many obstacles in its implementation such as the lack of trained personnel and the subjectivity of the final result which is very much determined by the accuracy and expertise of the laboratory staff. Therefore, another method which is easier to work with and is faster, more sensitive is needed so TB cases can be reduced.
The loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is one method that can be used for the diagnosis of tuberculosis. LAMP uses the isothermal principle, at a temperature of 64 o C, to carry out the DNA copying reaction without the need for a thermal cycler machine such as the polymerization method (PCR), LAMP only requires a water bath or heat block that is simpler so that it can be used as a standard diagnosis as it is easy to work with in health service units including Puskesmas (community healthcare center). Although bacterial culture is the standard recommended by WHO for diagnosis of TB, this method is slow and expensive, making it difficult to become a widespread diagnostic tool. Meanwhile, LAMP is fast diagnostic method with the advantages of accuracy on par with bacterial culture method.
Which one is better between the LAMP method or the microscope use in the diagnosis of TB? The results of this study indicate that the LAMP method has better sensitivity than the microscopic method. It is also supported by the results of previous studies. The LAMP method only requires a temperature of 64 oC for one hour to carry out the DNA copying reaction effectively and efficiently. Visualization of results can also be done with the naked eye because the color change can be directly compared between positive and negative results. Determination of results using microscopic methods requires special skills in observing the number of bacteria in the prepared slides, the smear that is made also determines the result of the diagnosis, not all bacteria contained in the sputum sample can be caught in the 2 cm x 3 cm slides commonly used in microscopic method, so the final result tends to be subjective.
A precise, fast, and accurate diagnosis is the first door to success in the treatment of diseases caused by Mycobacterium tuberculosis species, which are still claiming many victims. LAMP can be a new alternative in the TB diagnosis process to support end TB programs launched by WHO, especially in developing countries with technological limitations. LAMP method is simple without the need of a special machine used as a reference in confirming the TB diagnosis results with the same quality as the PCR method. Due to its simplicity and effectiveness, the LAMP method also allows it to be used in emergencies in the field as long as it maintains occupational safety and security standards.
Author: Ni Njoman Juliasih (ITD UNAIR)
Picture Source : lampost.co.id
Full article availabel at: http://medicopublication.com/index.php/ijfmt/article/view/10749{:}{:id}Tuberkulosis (TBC) masih menjadi masalah kesehatan global. Diperkirakan 10 juta orang terinfeksi TBC setiap tahunnya di seluruh dunia. Lebih dari 95% kematian akibat TBC terjadi di negara berkembang. Indonesia merupakan salah satu negara dengan masalah TBC terbanyak (high burden country) dan menduduki peringkat ketiga setelah India dan China. Diperkirakan terdapat 845.000 kasus TBC di Indonesia pada tahun 2018 dan 24.000 diantaranya merupakan kasus TB resisten obat. Penyebab utama tingginya kasus TBC adalah kemiskinan, kurang optimalnya program pengobatan TBC serta perubahan demografi akibat peningkatan jumlah penduduk. Di samping pengobatan, diagnosis TBC memiliki peran penting dalam mengatasi permasalahan ini. Secara sederhana, diagnosis TBC dapat dilakukan dengan melihat apusan dahak dengan menggunakan mikroskop. Namun metode ini memiliki banyak kendala dalam pelaksanaannya seperti kurangnya petugas terlatih dan subjektifitas hasil akhir yang sangat ditentukan oleh ketelitian dan keahlian si petugas laboratorium. Oleh karena itu, diperlukan metode lain yang lebih mudah pengerjaannya serta lebih cepat, sensitif, dan spesifik dalam diagnosis sehingga dapat menurunkan penularan dan kasus TBC.
The loop-mediated isothermal amplification (LAMP) merupakan salah satu metode yang dapat digunakan untuk diagnosis TBC. LAMP menggunakan prinsip isotermal, pada suhu 64oC saja, untuk menjalankan reaksi pengkopian DNA tanpa memerlukan mesin thermal cycler seperti metode polimerisasi (PCR), LAMP hanya membutuhkan water bath atau heat block yang lebih sederhana sehingga dapat dipakai untuk standar diagnosis yang mudah dikerjakan di unit pelayanan kesehatan termasuk Puskesmas. Meskipun kultur bakteri merupakan standar baku untuk diagnosis TBC yang direkomendasikan WHO, namun metode ini lambat dan mahal sehingga sulit untuk dijadikan alat diagnosis secara luas. Sedangkan LAMP memiliki kecepatan diagnosis layaknya mikroskop dengan kelebihan ketepatan diagnosis layaknya metode kultur bakteri.
Manakah yang lebih baik antara metode LAMP atau mikroskop dalam diagnosis TBC? Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa metode LAMP memiliki sensitivitas yang lebih baik daripada metode mikroskopis, hal tersebut juga didukung dengan hasil penelitian sebelumnya. Metode LAMP hanya membutuhkan suhu 64oC selama satu jam untuk menjalankan reaksi pengkopian DNA secara efektif dan efisien. Visualisasi hasil pun dapat dilakukan dengan mata telanjang karena perubahan warna dapat langsung dibandingkan antara hasil positif dan negatif. Penentuan hasil dengan metode mikroskopis memerlukan keterampilan khusus dalam mengamati jumlah bakteri yang berhasil ditangkap dalam preparat, preparat apusan yang dibuat juga sangat menentukan hasil diagnosis, tidak semua bakteri yang terdapat dalam sampel dahak dapat tertangkap dalam preparat ukuran 2 cm x 3 cm yang biasa digunakan dalam metode mikroskopis, sehingga hasil akhir yang didapatkan cenderung subjektif.
Diagnosis yang tepat, cepat, dan akurat menjadi pintu awal kesuksesan dalam pengobatan penyakit akibat infeksi bakteri spesies Mycobacterium tuberculosis yang sampai sekarang masih menelan banyak korban. LAMP dapat menjadi alternatif baru dalam proses diagnosis TBC untuk mendukung tercapainya end TB program yang dicanangkan WHO terutama di negara-negara berkembang yang memiliki keterbatasan teknologi. Penggunaan LAMP yang sederhana tanpa memerlukan mesin khusus dapat dijadikan acuan dalam mengkonfirmasi hasil diagnosis TBC yang sama kualitasnya dengan metode PCR. Karena kesederhanaan dan keefektifannya, metode LAMP juga memungkinkan untuk digunakan dalam keadaan darurat di lapangan asalkan tetap mempertahankan standar keamanan dan keselamatan kerja.
Penulis: Ni Njoman Juliasih (ITD UNAIR)
Sumber Gambar : lampost.co.id
Link terkait tulisan di atas: http://medicopublication.com/index.php/ijfmt/article/view/10749{:}